In der Klinik für Kinder- & Jugendmedizin werden Erkrankungen des Stoffwechsels, Magen-Darm-Trakts, der Atemwege, Blut- & Tumor-, Infektions-, rheumatische & neurologische Erkrankungen behandelt. 

Schwerpunkte der Kinderchirurgischen Klinik sind die operative Therapie von angeborenen Fehlbildungen, akute Verbrennungs- und Narbenbehandlung, Tumorchirurgie und Unfallheilkunde.

In der Klinik für Neonatologie werden Frühgeborene und kranke Neugeborene behandelt. Auch die Kinderintensivstation ist an die Klinik angegliedert. Schwerpunkt ist das Lungenersatzverfahren ECMO.

Das Zentrum für Kinder- und Jugendurologie bündelt die operativen und therapeutischen Ressourcen zur Diagnostik und Therapie sämtlicher den Urogenitaltrakt betreffenden Anomalien Erkrankungen.